נחל קומראן, המוזכר בתנ"ך, היווה ומהווה מקור השראה לסופרים ואומנים רבים ברחבי העולם. תוואי הנחל מתחיל בהר מונטר ברמת המדבר, שנשפך לחלקו הצפוני של ים המלח סמוך לקיבוץ קלי"ה, מדרום לנחל אוג ומצפון לנחל קדרון.

היישוב קומראן היה יישוב יהודי שהתקיים בתקופת בית שני. תושבי היישוב היו כת דתית מיוחדת, הידועה בשם "כת ה"יחד" (האיסיים) . הם כתבו והעתיקו כתבי יד רבים, ביניהם את מגילות ים המלח.
הכת התגוררה ביישוב במשך כ-200 שנה, עד שהיישוב נהרס בשנת 68 לספירה על ידי הצבא הרומי.

מערות קומראן הצמודות ליישוב הן מערות טבעיות הממוקמות מעל אפיקו של נחל הקומראן שבהן התגלו מגילות ים המלח.
בשנת 1946 התגלתה המערה הראשונה, ולאחר מכן התגלו עוד עשרות מערות שמתוכן הוצאו כ900 מגילות, שכוללות טקסטים מקראיים, תלמודיים, ואזוטריים.